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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
28/03/2016 |
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Data da última atualização: |
15/04/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; ORMEÑO-ORRILLO, E.; PARMA, M. M.; MELO, I. S. de; MARTÍNEZ-ROMERO, E.; HUNGRIA, M. |
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Afiliação: |
JAKELINE RENATA MARÇON DELAMUTA, UEL; RENAN AUGUSTO RIBEIRO, CNPq; ERNESTO ORMENO-ORRILLO, Universidad Nacional Agraria La Molina; MARCIA MARIA PARMA, CNPMA; ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA; ESPERANZA MARTINEZ-ROMERO, Universidad Nacional Autonoma de Mexico; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
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Título: |
Bradyrhizobium tropiciagri sp. nov. and Bradyrhizobium embrapense sp. nov., nitrogen-fixing symbionts of tropical forage legumes. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Reading, v. 65, n. 12, p. 4424-4433, 2015. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Abstract: Biological nitrogen fixation is a key process for agriculture production and environmental sustainability, but there are comparatively few studies of symbionts of tropical pasture legumes, as well as few described Bradyrhizobium species, although it is the predominant 48 genus in the tropics. A detailed polyphasic study was conducted with two Bradyrhizobium strains used in commercial inoculants for tropical pastures in Brazil, CNPSo 1112T isolated from perennial soybean (Neonotonia wightii), and CNPSo 2833T from desmodium (Desmodium heterocarpon). Based on 16S-rRNA phylogeny, both strains were grouped in the B. elkanii superclade, but were not clearly clustered with any known species. MLSA of three (glnII, gyrB and recA) and five (+ atpD and dnaK) housekeeping genes confirmed that the strains are positioned in two distinct clades. Comparison with ITS sequences of described Bradyrhizobium species showed similarity lower than 93.1%, and differences were confirmed by BOX-PCR analysis. Nucleotide identity of three housekeeping genes with described species ranged from 88.1% to 96.2%. ANI of genome sequences showed values below the threshold of Bradyrhizobium species (? 90.6%) and also between the two strains (91.2%). The analysis of nifH and nodC genes positioned the two strains in a distinct clade from other Bradyrhizobium species. Morpho-physiological, genotypic and genomic data supported the description of two novel clades in the genus Bradyrhizobium, B. tropiciagri sp. nov. (type strain CNPSo 1112T =SMS 303T =BR 1009T =SEMIA 6148T =LMG 28867T) and B. embrapense sp. nov. (type strain CNPSo 2833T =CIAT 2372T =BR 2212T =SEMIA 6208T =U674T). MenosAbstract: Biological nitrogen fixation is a key process for agriculture production and environmental sustainability, but there are comparatively few studies of symbionts of tropical pasture legumes, as well as few described Bradyrhizobium species, although it is the predominant 48 genus in the tropics. A detailed polyphasic study was conducted with two Bradyrhizobium strains used in commercial inoculants for tropical pastures in Brazil, CNPSo 1112T isolated from perennial soybean (Neonotonia wightii), and CNPSo 2833T from desmodium (Desmodium heterocarpon). Based on 16S-rRNA phylogeny, both strains were grouped in the B. elkanii superclade, but were not clearly clustered with any known species. MLSA of three (glnII, gyrB and recA) and five (+ atpD and dnaK) housekeeping genes confirmed that the strains are positioned in two distinct clades. Comparison with ITS sequences of described Bradyrhizobium species showed similarity lower than 93.1%, and differences were confirmed by BOX-PCR analysis. Nucleotide identity of three housekeeping genes with described species ranged from 88.1% to 96.2%. ANI of genome sequences showed values below the threshold of Bradyrhizobium species (? 90.6%) and also between the two strains (91.2%). The analysis of nifH and nodC genes positioned the two strains in a distinct clade from other Bradyrhizobium species. Morpho-physiological, genotypic and genomic data supported the description of two novel clades in the genus Bradyrhizobium, B. tropiciagri ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
ANI; Biological nitrogen fixation; Inoculant; MLSA. |
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Thesaurus Nal: |
Bradyrhizobium; nitrogen-fixing bacteria; nodulation. |
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Categoria do assunto: |
--
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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773 $tInternational Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Reading$gv. 65, n. 12, p. 4424-4433, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 18 | |
| 2. |  | UCHÔA, F. P.; MARIOBO, S. A. R.; ANJOS, E. F. M. dos; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F. Aproveitamento da radiação solar para controle de nematoides-das-galhas em solo para produção de mudas de café. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 34.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 3. | | PEQUENO, P. L. de L.; SCHLINDWEIN, J. A.; LOCATELLI, M.; LEONIDAS, F. das C.; RUDNICK, V. A. de S.; REGIS, P. F.; SOUZA, G. I. A. de. Caracterização de dez áreas com café conilon arborizado na Zona da Mata de Rondônia. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Coletânea de anais: I a VII. Brasília: Embrapa Café, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 4. | | ANJOS, E. F. M. dos; MARIOBO, S. A. R.; RUDNICK, V. A. de S.; SILVA, G. R. da; FIGUEIREDO, M. C.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Efeito da incorporação de Copaifera sp. e Vismia guianensis ao substrato no controle do nematoide-das-galhas do cafeeiro. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 37.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 5. | | RUDNICK, V. A. de S.; SCHLINDWEIN, J. A.; MARCOLAN, A. L.; CAVALCANTE, N. C.; MILITÃO, J. S. T. L.; MACHADO, A. P. Efeito do uso e manejo da pastagem na fertilidade do solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 6. | | SILVA, R. M. de L.; UCHÔA, F. P.; FIGUEIREDO, M. C.; SILVA, G. R. da; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Extratos de crotalaria e mucuna no controle de Meloidogyne incognita in vitro. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 7. | | SILVA, L. C. da; MENONCIN, I. A.; SILVA, T. M. e; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R.; COSTA, R. S. C. da. Fungos micorrízicos arbusculares como controle biológico do nematoide-das-galhas em Coffea canephora. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 31.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 8. | | SILVA, T. M. da; UCHOA, F. P.; FIGUEIREDO, M. C.; SILVA, G. R. da; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Determinação de concentração para rizobactérias in vitro no controle de Meloidogyne incognita para aplicação in vivo. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 39.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 9. | | SILVA, L. C. da; MENONCIN, I. A.; SILVA, T. M. e; RUDNICK, V. A. de S.; COSTA, R. S. C. da; VIEIRA JUNIOR, J. R. Influência da colonização radicular de FMA em mudas de Coffea Canephora contra nematoide-das-galhas. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 32.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 10. | | SILVA, G. R. da; FIGUEIREDO, M. C.; UCHOA, F. P.; SILVA, R. M. L.; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Resistência a nematoide-das-galhas em progênies de Coffea canephora variedade Robusta no bioma amazônico. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 27.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 11. | | FIGUEIREDO, M. C.; SILVA, G. R. da; UCHOA, F. P.; SILVA, R. M. de L.; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Resistência dos clones Robusta Amazônico a nematoide-das-galhas. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 38.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 12. | | ALVES, V. F.; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R.; ESPINDULA, M. C.; UCHÔA, F. P.; SILVA, D. M. da. Resposta de resistência de clones superiores de cafeeiros Coffea canephora ao nematoide-das-galhas. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 12.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 7., 2022, Porto Velho. Anais... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2022. p. 26.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 13. | | SILVA, L. C. da; COSTA, R. S. C. da; VIEIRA JUNIOR, J. R.; RUDNICK, V. A. de S.; MENONCIN, I. A.; SILVA, T. M. e. Supressão de nematoides-das-galhas do cafeeiro por fungos micorrizicos arbusculares. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 14. | | VIEIRA JUNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F.; RUDNICK, V. A. de S.; MATOS, S. I.; FREIRE, T. C.; FONSECA, A. S.; MARREIROS, J. A. A.; SILVA, M. A. da; CARVALHO, J. A. de; SILVA, D. S. G. da. Ocorrência da mancha aureolada do cafeeiro em Rondônia. Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2015. 4 p. (Embrapa Rondônia. Comunicado Técnico, 401).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 15. | | UCHÔA, F. P.; VIEIRA JUNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F.; ROCHA, R. B.; ESPINDULA, M. C.; RUDNICK, V. A. DE S; SILVA, D. M. DA; FREIRE, T. C.; SANGI, S. C.; MARIOBO, S. A. R. Evaluation of a prototype of soil thermal solarizer for control of gall nematode in the production of coffee seedlings. Coffe Science, v. 18, e182014, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Café; Embrapa Rondônia. |
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| 16. | | SILVA, D. M. da; VIEIRA JUNIOR, J. R.; ROCHA, R. B.; ESPINDULA, M. C.; RUDNICK, V. A. de S.; FERNANDES, C. de F.; UCHÔA, F. P.; BASTOS, J. S. F.; FREIRE, T. C.; SANGI, S. C.; FONSECA, A. S. da. Resistance of Coffea canephora as a sustainable tool for Meloidogyne incognita control. Coffee Science, 17:e172018, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Rondônia. |
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| 17. | | RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JÚNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F.; ROCHA, R. B.; TEIXEIRA, A. L.; RAMALHO, A. R.; ESPINDULA, M. C.; SANTOS, A. V.; ANJOS, E. F. M. dos; UCHÔA, F. P. Resistance of new Coffea canephora clones to root-knot nematode (Meloidogyne incognita) in the western amazon. Coffee Science, v. 15, e151708, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Rondônia. |
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| 18. | | VIEIRA JUNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F.; RUDNICK, V. A. de S.; ROCHA, R. B.; RAMALHO, A. R.; MATOS, S. I.; FREIRE, T. C.; FONSECA A. S. da; MARREIROS, J. A. A.; ZEFERINO, D. M.; SILVA, D. S. G. da; SOARES, G. T.; GOMES, F. G.; LIMA, G. M.; SILVA, E. A. M. da; FREIRE, M. A.; CARVALHO, J. A. de. Rhizoctoniose x fusariose x roseliniose do cafeeiro: saiba diferenciar para melhor manejar. Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2015. (Embrapa Rondônia. Comunicado técnico, 402).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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